太平洋垃圾岛因核废料突变，诞生了能够吞噬一切有机物并无限分裂的泥浆怪兽——黑多拉。它登陆东京，将半个城市化为污泥。正在此时，海底沉睡的哥吉拉因感知到更大的生态失衡而苏醒。自卫队无力抵挡。哥吉拉与黑多拉在东京湾展开毁灭性对决。黑多拉能液化逃逸并释放毒气，哥吉拉则用原子吐息焚烧一切。最终哥吉拉以自毁方式引发体内核聚变，将黑多拉彻底气化，自己也沉入海底。

东宝经典IP的现代化重启，特效场面极具压迫感。影片将环保主题融入怪兽对决，黑多拉的设定极具当代警示意义。决战戏份的视觉冲击力堪称年度最佳之一。